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在单细胞单分子水平分析人体内的lncRNAs

2016年07月15日 00:00 细胞治疗中心---于菲 点击:[]

长链非编码RNA(lncRNA)是指至少有200个碱基长并且本身不会编码蛋白的序列。lncRNA占总RNA的比列可达4-9%,存在于很多不同种类的组织中,而且经常在细胞内特定位置处被发现,可以在多层面上调控基因的表达,但作用机制非常复杂,至今尚未完全清楚。来自布罗德研究所和宾夕法尼亚大学的研究人员利用一种名为单分子荧光原位杂交(single-molecule RNA FISH)的技术,成功辨别出61个位于皮肤、肺和宫颈肿瘤细胞内的lncRNA分子的位置。研究发现细胞群测量的低丰度lncRNAs不能通过“jackpot”细胞的一个亚群的高表达来解释。核内lncRNA在有丝分裂过程中发生溶解并被广泛分散,表明这些lncRNAs并不是有丝分裂的标签性因素。此外,转录方向相反的lncRNAs并不总是与他们同族的mRNA有一一对应关系,也没有一个典型的位置模式。此项研究不仅提供了在单细胞水平上lncRNAs的定量表征,而且为以后工作提供了lncRNAs研究进行验证的普遍适用方法。

http://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-015-0586-4

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